前身是1970年6月28日成立的吴江县血防治疗组，1972年6月成立平望地区医院，1984年12月30日更名为吴江县第二人民医院，1992年5月4日随吴江县撤县建市改名为吴江市第二人民医院。1987年9月经苏州市编委、苏州市卫生局批准，床位数由150张增加到170张，人员定编261人。2005年7月13日，根据吴江市委、市政府及市卫生局的统一部署，原吴江市中医院与原吴江市第二人民医院整体合并，成立新吴江市第二人民医院。
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